La Sociedad Mexicana de Estudios Electorales tiene sus raíces en el trabajo desarrollado por el Grupo Especializado en Estudios Electorales del Consejo Mexicano de Ciencias Sociales --COMECSO--, que nació en 1986 de la inquietud de investigadores universitarios interesados en profundizar en el estudio de la creciente competitividad electoral mexicana. Desde entonces, la trayectoria del grupo permitió fomentar y difundir la investigación político-electoral tanto en las universidades del país como en los institutos y organismos electorales.

Los encuentros anuales que comenzó a organizar este conjunto de académicos permitieron consolidar y cohesionar al grupo, que muy pronto se constituyó en el mejor organizado de los grupos especializados del COMECSO, incluso hasta llegar a rebasar los objetivos de la matriz que le dio cobijo institucional en su origen.

En 1989, se realizó el II Encuentro Nacional se llevó a efecto en Chapala, Jalisco, con el apoyo de la Universidad de Guadalajara.

En 1991 se realizó el III Encuentro Nacional, bajo el auspicio de la Universidad Autónoma de Hidalgo.

A partir del IV Encuentro Nacional, realizado con el patrocinio de la Universidad Autónoma de Nayarit en la ciudad de Tepic en 1992, los encuentros del grupo especializado adoptaron una periodización anual.

En noviembre de 1993 se realizó el V Encuentro Nacional del Grupo Especializado en Estudios Electorales en Valle de Bravo, Estado de México; de nueva cuenta con el auspicio de la Universidad Autónoma del Estado de México.

El VI Encuentro Nacional se realizó bajo los auspicios del Departamento de Sociología de la Universidad Autónoma Metropolitana Iztapalapa.

El VII Encuentro Nacional fue auspiciado por el Centro de Investigaciones Interdisciplinarias sobre el Desarrollo Regional -Maestría en Análisis Regional (CIISDER-MAR) de la Universidad Autónoma de Tlaxcala.

El VIII se realizó en Guanajuato, encuentro congregó a 96 ponentes de 25 entidades del país.

En 1997 Luego, en noviembre, se realizó el IX Encuentro Nacional en Zacatecas. Fue ahí donde se definió la necesidad de integrarse formalmente como asociación civil, y se determinó que una comisión de colegas se encargase de emprender los pasos necesarios para la formalización jurídica de la nueva asociación.

Desde entonces, durante varios meses se discutieron los estatutos que sustentarían la nueva organización. Finalmente se concluyeron los trabajos preparatorios y el 10 de julio de 1998 se firmó el acta constitutiva bajo el cobijo institucional de la Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, en Morelia desde entonces la SOMEE ha organizado los Congresos Nacionales de Estudios Electorales:

X en La Paz, B.C.S., con el apoyo de la Universidad Autónoma de Baja California Sur.

XI en Puebla, con el apoyo de la Benemérita Universidad Autónoma de Puebla;

XII en la Ciudad de México, con el apoyo de la Universidad Autónoma Metropolitana, el Instituto Federal Electoral y el Instituto Electoral del Distrito Federal;

XIII con el apoyo de la Universidad Veracruzana, el Instituto Federal Electoral;

XIV con el apoyo del Consejo Estatal Electoral de Sinaloa, el Tribunal Estatal Electoral de Sinaloa, la Universidad Autónoma de Sinaloa, la Universidad de Occidente y el Instituto Federal Electoral.